科学技术处设科研管理科、科技成果管理科、科技平台管理科、社会科学管理科、期刊管理办公室和《山东农业大学学报》（自然科学版）编辑部、《山东农业大学学报》（社会科学版）编辑部等7个科室（部），负责全校科学研究、科技奖励、知识产权、科技创新平台建设、学术交流及学报自然科学版、学报社会科学版的管理工作。目前在岗职工13人，其中处长1人，副处长2人，副编审3人，编辑1人。主要职责是：
1.根据国家和省的科技方针，结合学校实际，编制全校科技发展中长期规划、年度计划，推动科技创新。
2.组织教师积极承担国家、地方科技任务；申报课题，多渠道争取科技经费；做好项目综合管理。
3.组织和督促科研计划的实施，协调各单位间课题协作，检查计划执行情况。
4.组织课题验收、专利申请、奖励申报等。
5.负责知识产权管理。
6.会同财务部门做好科研经费的管理、使用。
7.负责高校科协工作和挂靠学会的管理，积极开展校内学术交流活动。
8.组织学报（自然科学版）、学报（社会科学版）的编辑出版。
9.负责校学术委员会办公、日常管理工作。
10.配合有关部门做好技术保密、科技档案的管理工作。
11.制定和完善科技处职责范围内各项工作的管理方法、规定；组织编报科技统计和科技年报工作。